我国是产棉大国，棉粕资源丰富，棉粕在质量和产量上是一种仅次于豆粕的优质植物性蛋白原料。棉粕蛋白质含量高，氨基酸种类丰富，但由于含有多种抗营养因子而限制了其在饲料中的应用。利用微生物发酵可有效降低棉粕抗营养因子并提高其营养价值，是对精细化的化学脱毒工艺的积极补充并且也是符合可持续高质量发展趋势、更为生态环保的绿色技术与绿色产品。与普通棉粕相比，微生物发酵具有以下优势：
（1）微生物发酵去除棉粕抗营养因子
微生物发酵棉粕过程中可产生多种酶类，如蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶和植酸酶等，这些酶可降解棉粕的抗营养因子如游离棉酚、非淀粉多糖、植酸等。与萃取法、膨化法、化学法等对棉籽粕中游离棉酚进行脱毒的方法相比，微生物发酵法不仅对游离棉酚有去除作用，而且对其他的抗营养因子也具一定的去除作用，同时生产成本低，无化学残留；同时符合资源化和无害化程度最大的循环经济发展的新趋势与新要求。微生物发酵棉粕，平均脱毒率大于50%，个别优异菌株及其组合脱毒率达95%以上，大大降低游离棉酚对动物繁殖性能的影响和消化道损伤。
（2）微生物发酵提高棉粕营养价值
发酵对棉粕细胞壁破坏更加彻底，促进内容物释放，利于吸收；发酵过程中微生物产生的酶降解大分子蛋白质为小分子蛋白质，增加小肽含量，提高动物体内消化速度和利用率；发酵也能降解一部分棉粕粗纤维；乳酸菌发酵棉粕还可以增加有机酸含量，既可抑制有害微生物的增殖，尤其是可显著改善棉粕的适口性。
